More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5648 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 162 aa  328  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  67.97 
 
 		 161 aa  221  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  67.33 
 
 		 160 aa  213  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  66.67 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 192 aa  191  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 165 aa  177  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  58.55 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 192 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  54 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  48.41 
 
 		 161 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  50.67 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  50.67 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  50.67 
 
 		 153 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  50 
 
 		 153 aa  157  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  48 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  52 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  48.39 
 
 		 126 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  34.81 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  34.81 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 121 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  41.33 
 
 		 155 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 165 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 154 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  36.42 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  36.84 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 163 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  31.01 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  98.6  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  98.2  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  32.47 
 
 		 172 aa  97.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 171 aa  97.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  97.1  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 188 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 157 aa  94.7  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4109  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 160 aa  94.4  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 162 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.05 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  34.55 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  34.67 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  31.41 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  31.41 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  31.33 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 160 aa  91.7  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 161 aa  91.3  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>