More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0535 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  327  6e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  80.62 
 
 		 165 aa  269  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 163 aa  237  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  70.44 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  69.81 
 
 		 161 aa  223  9e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  72.34 
 
 		 163 aa  221  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 163 aa  221  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  63.87 
 
 		 171 aa  204  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  62.75 
 
 		 168 aa  190  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  59.48 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 163 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 164 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  37.91 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  37.91 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  38.31 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 155 aa  101  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  38.06 
 
 		 155 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 165 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 165 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 153 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 153 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.99 
 
 		 167 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 161 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 192 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  41.38 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0273  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  33.99 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  33.99 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  33.99 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 191 aa  91.3  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0133  helix-turn-helix, Fis-type  34.01 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 		 169 aa  91.3  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  33.33 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 		 155 aa  90.9  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 159 aa  90.5  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  36.02 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  36.02 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  36.02 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  36.02 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  36.42 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>