More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1870 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  56.95 
 
 		 160 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  54.97 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 192 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  45.03 
 
 		 153 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  45.03 
 
 		 153 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  45.03 
 
 		 153 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  45.03 
 
 		 153 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  49.01 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  49.01 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 155 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  46 
 
 		 155 aa  149  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  45.7 
 
 		 161 aa  148  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  43.71 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  52.56 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 158 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  38.41 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 165 aa  121  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 121 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 153 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 161 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.76 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 155 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  35.76 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 159 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 154 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  32 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 159 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 159 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 163 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 163 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 164 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 154 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.89 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  32.89 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  29.87 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2193  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 167 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 154 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 153 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 166 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 163 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 162 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7349  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 166 aa  99  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 162 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0007  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 169 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2201  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 156 aa  99  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 160 aa  99  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  34.38 
 
 		 162 aa  98.6  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0362  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 169 aa  98.6  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.77 
 
 		 153 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 162 aa  98.6  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 163 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0459  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 169 aa  98.2  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.32133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  31.79 
 
 		 165 aa  97.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0010  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 169 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.103438  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 155 aa  97.8  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 156 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.12 
 
 		 162 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>