More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1442 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  97.11 
 
 
173 aa  344  4e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  51.03 
 
 
160 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  51.03 
 
 
160 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 
154 aa  140  7e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
159 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  45.03 
 
 
156 aa  136  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  42.11 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
155 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  38.41 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 
192 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  35.85 
 
 
161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 
165 aa  127  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  40.61 
 
 
229 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 
202 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  42.86 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  42.86 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  42.86 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40.61 
 
 
202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  42.86 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
152 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 
155 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
152 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 
153 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
157 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  34.81 
 
 
162 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
153 aa  123  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
164 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
155 aa  123  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
159 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
164 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 
175 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  39.19 
 
 
153 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
152 aa  122  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
160 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  37.58 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  37.58 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  37.58 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  37.58 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0508  glutamate uptake regulatory protein  37.58 
 
 
152 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.892509 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40.38 
 
 
162 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
154 aa  120  9e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 
175 aa  120  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
222 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
157 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  38.04 
 
 
222 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  38.04 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  38.04 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  38.04 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  38.04 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  38.04 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  38.04 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 
162 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
156 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  38.22 
 
 
165 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 
162 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
162 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
161 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  42.14 
 
 
163 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
155 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  39.61 
 
 
165 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
162 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 
153 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
165 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  39.04 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1175  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
218 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.69 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  39.07 
 
 
162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  38.56 
 
 
161 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
171 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
156 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
154 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  35.95 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 
213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0241  AsnC family transcriptional regulator  37.42 
 
 
174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>