More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5228 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5228  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  327  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 163 aa  321  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  98.77 
 
 		 163 aa  321  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2723  AsnC family transcriptional regulator  97.55 
 
 		 163 aa  320  5e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3395  AsnC family transcriptional regulator  98.16 
 
 		 163 aa  320  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  94.48 
 
 		 185 aa  314  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  80.25 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  80.89 
 
 		 164 aa  255  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0516  AsnC family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.516806  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3060  AsnC family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.392754  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0637  AsnC family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1230  AsnC family transcriptional regulator  79.62 
 
 		 164 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.550157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 160 aa  168  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4037  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 171 aa  153  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0619  transcriptional regulator, AsnC family  54.61 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0640  AsnC family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  51.95 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1081  AsnC family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  37.24 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  36.55 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  36.67 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1659  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.31019  normal  0.273663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1990  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.141708  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 166 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 163 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 165 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 192 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 192 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 154 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  37.86 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 165 aa  97.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2442  AsnC family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.127715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  33.99 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  36.24 
 
 		 152 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  37.06 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0449  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 156 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  94.4  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  94  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  35.03 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4811  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0257  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 166 aa  92.8  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  35.57 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0376  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24101  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.11 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  32.85 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  38.24 
 
 		 173 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  36.43 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>