More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2574 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 158 aa  193  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 158 aa  193  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 158 aa  193  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  53.02 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  47.33 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  47.33 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  47.33 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  47.33 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 192 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  45.64 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  43.71 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  40.4 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  34.87 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 165 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  32.89 
 
 		 155 aa  97.4  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 154 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 154 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  35.76 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  30.87 
 
 		 161 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  30.77 
 
 		 173 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 186 aa  83.6  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  29.53 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2595  transcriptional regulator, AsnC family  30.26 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  28 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0945  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3470  AsnC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  26.32 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  26.85 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1094  transcriptional regulator, AsnC family  29.25 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.171646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3501  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.526835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  30.92 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  30.46 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  27.52 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5169  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1559  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193635  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6646  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1457  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1425  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4075  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  28.19 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  26.85 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  26.85 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3446  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>