More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5630 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  98.1 
 
 		 158 aa  321  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  94.3 
 
 		 158 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  94.94 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  94.19 
 
 		 158 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  76 
 
 		 180 aa  245  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  62.67 
 
 		 155 aa  193  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  56.58 
 
 		 161 aa  177  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  55.48 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  55.19 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 192 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  54.97 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  47.02 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  50.67 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  47.02 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  47.02 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  46.36 
 
 		 153 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  44.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 192 aa  134  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  46.1 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  121  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0948  AsnC family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0096  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00293139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  44 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  34.44 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  34.44 
 
 		 173 aa  104  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  35.33 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0319  transcription regulator AsnC  35.33 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  35.1 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0559  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1000  transcriptional regulator, AsnC family  36.6 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5900  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  34 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  34 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  34 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  34.67 
 
 		 158 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1394  putative leucine-responsive regulatory protein  34.64 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  33.76 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 161 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 177 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  32 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  33.12 
 
 		 157 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8143  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0298504  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  31.97 
 
 		 154 aa  90.1  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 154 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0535  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 172 aa  89.4  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  30 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  29.33 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0674  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 165 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.462359  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  30 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  32.9 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3904  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 186 aa  87.4  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0974584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  30.67 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>