More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2554 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 		 154 aa  312  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  61.29 
 
 		 155 aa  189  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  45.33 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 		 172 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.91 
 
 		 156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  124  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  38.96 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  38.31 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.31 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 156 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 152 aa  116  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  36.49 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  38.67 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 164 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  38.52 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  35.76 
 
 		 159 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  38.67 
 
 		 169 aa  111  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 154 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  35.76 
 
 		 169 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2098  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 165 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 153 aa  107  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.06 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  37.16 
 
 		 186 aa  104  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3124  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5346  hitchhiker  0.0061369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  103  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 169 aa  103  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  103  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2235  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.11 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2511  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 167 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.77 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 159 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  32.67 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  33.77 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  33.77 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>