More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3139 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 		 153 aa  309  9e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  78.52 
 
 		 150 aa  245  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 153 aa  194  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  53.59 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  50.68 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 152 aa  154  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 		 167 aa  147  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 172 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.75 
 
 		 155 aa  123  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  39.58 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  41.96 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  41.33 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  39.74 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  39.86 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1883  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1868  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  35.76 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.19 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34.44 
 
 		 156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  34.48 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0033  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000210116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 155 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.33 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0468  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.674302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  35.33 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 155 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2964  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 172 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  33.1 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 154 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 198 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 282 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1508  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.677694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0461  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 198 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1379  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1375  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0281186  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>