More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4193 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  307  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 156 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.67 
 
 		 155 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  34.9 
 
 		 154 aa  107  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  35.37 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  34.44 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 169 aa  104  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0873  AsnC family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.286103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  34.44 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  34.44 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  34.44 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  34.9 
 
 		 229 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  34.9 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  34 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2585  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.37 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 153 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1553  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0410589  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  34.23 
 
 		 229 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 160 aa  100  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1683  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  33.33 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2055  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.650647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.77 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 163 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2497  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.38008  normal  0.590435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  29.53 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  31.94 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 165 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  33.77 
 
 		 162 aa  97.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 155 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 158 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  35.06 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 198 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  33.57 
 
 		 159 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 161 aa  97.4  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1090  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4315  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.169505  normal  0.387948 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1090  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.540988  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1207  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.371155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2096  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0727  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1180  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.210779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1179  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.876809  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  31.76 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0691  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 282 aa  96.7  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0463656  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>