More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6858 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 167 aa  343  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  44.6 
 
 		 153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  45.83 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 152 aa  133  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 153 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  39.04 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.24 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0580  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 178 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000015391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3558  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 162 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1967  HTH-type transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0328  transcriptional regulator, AsnC family protein  35.92 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0403986  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 195 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 165 aa  107  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  36.17 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 155 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2055  transcriptional regulator AsnC family  37.24 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.381037  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 182 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3924  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 150 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  38.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  37.67 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  38.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  38.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4193  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.209273  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  38.36 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 		 157 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0808  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.14 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 153 aa  104  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.79 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0653  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01449  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  33.76 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  37.67 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  37.67 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  37.67 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1404  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 153 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.393199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 156 aa  102  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  34.42 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  37.67 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4898  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817851  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1508  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0615903  normal  0.388273 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  35.57 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>