More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12558 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  60.93 
 
 		 152 aa  193  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  48 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  43.45 
 
 		 167 aa  126  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3139  regulatory protein AsnC/Lrp family  43.17 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.91917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  38.26 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  40.4 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 175 aa  123  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 202 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 229 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  39.87 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  39.07 
 
 		 229 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  38 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.33 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 		 153 aa  117  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  38.82 
 
 		 165 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  116  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  39.07 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  114  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  40.4 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  38.67 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  37.75 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1566  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 163 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00293265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2313  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 175 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2076  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 162 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  38 
 
 		 159 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2439  hypothetical protein  38.56 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0868  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.67 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0245  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 169 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3462  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2359  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554686  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1597  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21426  normal  0.972562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004016  putative HTH-type transcriptional regulator ybaO  37.5 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  38 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0860  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  38.67 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4125  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>