More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2821 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2821  regulatory protein AsnC/Lrp family  100 
 
 		 161 aa  333  7e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  54.55 
 
 		 155 aa  180  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  45.33 
 
 		 154 aa  140  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12558  putative AsnC-family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0640143  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 153 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0353  AsnC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 162 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3971  transcriptional regulator, AsnC family  34.84 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4473  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000700573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1144  putative transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12570  transcription regulator AsnC  37.66 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4155  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09960  transcriptional regulator, AsnC/Lrp family  37.01 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.130646  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 191 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  33.99 
 
 		 229 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3742  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.768367 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0301  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4405  transcriptional regulator, AsnC family  36.36 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.830471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 154 aa  105  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0461  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  29.8 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  35.33 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 157 aa  104  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1849  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 213 aa  104  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00276747  hitchhiker  0.0000000161296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 180 aa  103  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 156 aa  104  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  35.33 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 		 169 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  34.67 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1172  regulatory proteins, AsnC/Lrp  28.3 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7497  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000799666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  35.33 
 
 		 152 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4337  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  35.53 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1178  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.86 
 
 		 169 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3922  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4022  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0400  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.914468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3999  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2311  AsnC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.503537  hitchhiker  0.00316329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4115  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 166 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4319  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3352  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  35.53 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.868338  normal  0.404848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3888  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 188 aa  100  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.330604  normal  0.484921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0065  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  100  9e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0481565  normal  0.0654338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4776  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524712  hitchhiker  0.00402147 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4830  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3386  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0192  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.116505  hitchhiker  0.0000000264985 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4652  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0644  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0118  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0197  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  32.47 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0265  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.499617 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>