More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5098 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 169 aa  340  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  81.5 
 
 		 173 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  81.66 
 
 		 173 aa  278  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  81.07 
 
 		 173 aa  277  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  78.11 
 
 		 169 aa  274  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  77.51 
 
 		 169 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  77.51 
 
 		 169 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  77.51 
 
 		 169 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  77.51 
 
 		 169 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  75.15 
 
 		 169 aa  270  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  84.67 
 
 		 186 aa  267  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  82.78 
 
 		 152 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  82.78 
 
 		 152 aa  264  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  82.78 
 
 		 152 aa  264  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  73.96 
 
 		 169 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  79.33 
 
 		 175 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  73.37 
 
 		 191 aa  257  6e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  73.37 
 
 		 169 aa  256  8e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  80.67 
 
 		 166 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  80.67 
 
 		 166 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  80.67 
 
 		 166 aa  254  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1802  regulatory proteins, AsnC/Lrp  74.53 
 
 		 168 aa  251  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596593  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 178 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3674  transcriptional regulator, AsnC family  74.52 
 
 		 172 aa  246  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3309  AsnC family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 166 aa  243  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0359106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  71.34 
 
 		 174 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5214  AsnC family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 166 aa  241  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5156  AsnC family transcriptional regulator  80 
 
 		 166 aa  234  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.949798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2859  AsnC family transcriptional regulator  80 
 
 		 166 aa  234  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3496  transcriptional regulator, AsnC family  68.94 
 
 		 166 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  60 
 
 		 154 aa  184  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  58 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  48.34 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 158 aa  154  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 		 159 aa  153  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  47.3 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  44.52 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  43.87 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  43.87 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  45.03 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  42.48 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  42.58 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  42.48 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 155 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  40.79 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  42.38 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 181 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 		 152 aa  128  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  40.4 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 170 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  41.72 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  41.61 
 
 		 166 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  40.4 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40.4 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  41.06 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  39.49 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.06 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0399  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  38.06 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  41.33 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  41.22 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>