More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1385 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
158 aa  323  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  49.02 
 
 
158 aa  158  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5478  transcriptional regulator, AsnC family  51.72 
 
 
159 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00532694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0270  AsnC family transcriptional regulator  51.75 
 
 
153 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5854  transcriptional regulator AsnC family  48.32 
 
 
154 aa  147  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  46.2 
 
 
158 aa  143  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2822  AsnC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.448359 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4759  AsnC family transcriptional regulator  42.38 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1100  leucine-responsive regulatory protein, putative  41.33 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121035  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3829  AsnC family transcriptional regulator  41.06 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0951  putative leucine-responsive regulatory protein  40.67 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.191831  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0345  Lrp regulator  40.67 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1881  putative leucine-responsive regulatory protein  40.67 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.112233  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0217  putative leucine-responsive regulatory protein  40.67 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5406  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
169 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1387  putative leucine-responsive regulatory protein  40.67 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.292932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1797  putative leucine-responsive regulatory protein  40.67 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0428  putative leucine-responsive regulatory protein  40.67 
 
 
152 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749844  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  40.67 
 
 
166 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3619  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.378157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1802  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.61 
 
 
168 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596593  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1696  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
173 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.346249  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2003  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
173 aa  124  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.647714  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5396  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 
175 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1611  normal  0.0284366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3674  transcriptional regulator, AsnC family  40.13 
 
 
172 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5098  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 
169 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3597  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 
173 aa  121  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.680866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5214  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
166 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2859  AsnC family transcriptional regulator  42 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3309  AsnC family transcriptional regulator  40.79 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0359106 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3876  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
191 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3149  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
169 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5156  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.949798  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  39.33 
 
 
186 aa  117  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4492  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
178 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.67 
 
 
162 aa  114  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
164 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  36.67 
 
 
162 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 
174 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1446  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  36 
 
 
162 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
164 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  36 
 
 
162 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  36.55 
 
 
162 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
162 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
162 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 
162 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1596  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.699626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
159 aa  110  9e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  35.44 
 
 
155 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  34.93 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  36 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.73 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
152 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1369  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
153 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362978  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1571  leucine-responsive regulatory protein  38.03 
 
 
153 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.787387  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  5e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 
161 aa  107  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1518  leucine-responsive regulatory protein  38.03 
 
 
153 aa  107  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 
153 aa  107  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 
166 aa  107  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0922  alanine catabolic operon transcriptional regulator, putative  38.62 
 
 
155 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.491746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  36.55 
 
 
164 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
152 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
196 aa  106  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 
164 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 
152 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
181 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
160 aa  106  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 
159 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 
159 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 
153 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  36.55 
 
 
164 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>