More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4845 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  334  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  98.79 
 
 		 165 aa  330  6e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  97.55 
 
 		 165 aa  321  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  65.56 
 
 		 154 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  62.34 
 
 		 155 aa  204  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  64.05 
 
 		 154 aa  204  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  48.68 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 192 aa  121  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  41.56 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 160 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  36.6 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  40.67 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2443  transcriptional regulator, AsnC family  42.06 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000317014  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2708  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 155 aa  107  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.72891  normal  0.803716 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 158 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  33.12 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  33.12 
 
 		 173 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 180 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 156 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.132421  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  30.13 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 156 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 154 aa  97.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.17 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3408  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.703965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 		 159 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3180  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  32.17 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  32.17 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  32.17 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  32.17 
 
 		 153 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1522  AsnC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0922234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 155 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  30 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  29.68 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 157 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  28.37 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  27.74 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 153 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 155 aa  84  8e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00399  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00403  hypothetical protein  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  27.1 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0535  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  26.49 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  26 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3258  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650696  decreased coverage  0.000218809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0671  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.633798 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  30.56 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2859  AsnC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0033406  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  25.83 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0283  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.33489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>