More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0093 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0093  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.867547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1344  AsnC family transcriptional regulator  51.55 
 
 		 160 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.832275  normal  0.173091 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3532  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3718  AsnC family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 154 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.068144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3051  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4953  AsnC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 160 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.015081 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  37.18 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  35.03 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04927  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 161 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1870  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2839  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.787421  normal  0.151915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1442  hypothetical protein  35.25 
 
 		 173 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4424  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 155 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  hitchhiker  0.00000834706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4919  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 165 aa  97.8  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1542  hypothetical protein  35.25 
 
 		 173 aa  97.4  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5648  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 162 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7513  transcriptional regulator AsnC family  34.18 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1264  transcriptional regulator, AsnC family  30.06 
 
 		 161 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 167 aa  92  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.81 
 
 		 156 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  31.41 
 
 		 156 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2801  transcription regulator protein  31.39 
 
 		 158 aa  89.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.031775  normal  0.480036 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4408  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4298  transcriptional regulator, AsnC family  33.79 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 156 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 159 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5457  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223576 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4909  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 158 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0725114  normal  0.866361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0056  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 152 aa  85.9  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0948  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  35.21 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0983  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 150 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4599  AsnC family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  hitchhiker  0.00013057 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6397  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 154 aa  85.5  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340876  normal  0.176747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  35.21 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  35.21 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  35.21 
 
 		 153 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0726  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 162 aa  85.1  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.782638  normal  0.0301891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  33.33 
 
 		 156 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0789  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5010  transcriptional regulator AsnC family  36.36 
 
 		 155 aa  84.3  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5122  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 157 aa  84.3  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3752  hypothetical protein  33.61 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 157 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3039  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0212716  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 165 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0590  transcriptional regulator, AsnC family  30.77 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.336318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5327  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0321  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396921  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3966  AsnC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00108309  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4529  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0784834  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5233  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.935645  normal  0.378973 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3626  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00949051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3168  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.714414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5512  transcriptional regulator, AsnC family  31.25 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00034471 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0453  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0653  AsnC family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 160 aa  80.9  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0395  AsnC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 152 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0142877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0224  AsnC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306789  hitchhiker  0.0000194252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1900  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3168  hypothetical protein  32.1 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.254618  normal  0.523105 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3945  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  31.06 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  31.41 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  31.41 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  31.41 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0249  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 171 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0302  AsnC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.622195  hitchhiker  0.000130676 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2418  AsnC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0214034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0322  AsnC family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>