More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3210 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 161 aa  327  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  53.38 
 
 		 155 aa  163  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  52.38 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  48.32 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  47.65 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 181 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  39.07 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  37.82 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  37.82 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  38.31 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  36.54 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  36.42 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  35.95 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  37.25 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  107  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  35.06 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  36.84 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  35.06 
 
 		 166 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  36.18 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3830  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.676178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 157 aa  103  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2309  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293447 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 169 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5150  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 154 aa  101  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 162 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 167 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 162 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3221  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 176 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  37.84 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  37.84 
 
 		 162 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  36.6 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.6 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1616  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.636289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  36.3 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  35.57 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34.27 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  34.64 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  34.64 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  34.64 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>