More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2044 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  52.38 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 155 aa  150  7e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  45.89 
 
 		 154 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  45.21 
 
 		 154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  37.33 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  34.21 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  32.89 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 160 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 167 aa  97.4  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 170 aa  97.1  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  34 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.24 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1840  leucine-responsive transcriptional regulator  32.24 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  36.09 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  32.24 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  32.24 
 
 		 167 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 167 aa  94  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  94  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3332  transcriptional regulator AsnC family  33.11 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.37 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 168 aa  93.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  31.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 196 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2536  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.346096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  31.58 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2230  transcriptional regulator, AsnC family  32.45 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0766  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.364193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1187  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  31.58 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 153 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  32.24 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>