More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6708 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  61.54 
 
 		 167 aa  177  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 152 aa  156  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  54.48 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  54.17 
 
 		 156 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  52.74 
 
 		 152 aa  154  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  54.73 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 182 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  48.37 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  52.48 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  46.53 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  47.95 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  45.83 
 
 		 165 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  44.06 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  44.53 
 
 		 154 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  45.08 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  39.57 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 150 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 149 aa  103  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  38.82 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 162 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  43.48 
 
 		 160 aa  100  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 175 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 181 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  34.46 
 
 		 165 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 162 aa  97.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.13 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 186 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 154 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  38.3 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  40.87 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02115  leucine-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000100067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 170 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 		 159 aa  91.3  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 153 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  34.19 
 
 		 166 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 153 aa  90.5  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  35.21 
 
 		 156 aa  90.5  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 165 aa  90.1  9e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  34.53 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 144 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>