More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1426 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  67.86 
 
 
153 aa  207  3e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.94 
 
 
158 aa  146  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  47.22 
 
 
182 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  51.77 
 
 
150 aa  140  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  48.92 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  46.48 
 
 
149 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  48.92 
 
 
158 aa  135  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  48.57 
 
 
151 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  48.15 
 
 
143 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  43.88 
 
 
149 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  45 
 
 
152 aa  130  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
147 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  46.09 
 
 
156 aa  119  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  47.29 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  53.24 
 
 
166 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  53.24 
 
 
166 aa  118  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.17 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 
168 aa  114  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  44.53 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  52.14 
 
 
160 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.72 
 
 
167 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
153 aa  97.4  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  38.4 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  38.89 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06912  transcriptional regulator  37.96 
 
 
171 aa  87.8  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
153 aa  86.7  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  34.75 
 
 
153 aa  84.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.88 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
167 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35.48 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34.68 
 
 
161 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.51 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
153 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
157 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
175 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
172 aa  79  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2738  AsnC family transcriptional regulator  36.8 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.579335  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0065  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
157 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
168 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  34.68 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.88 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5122  transcriptional regulator, AsnC family  38.17 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  36.8 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  33.11 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  30.37 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3944  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  32.85 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
181 aa  74.7  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  32.85 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3966  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.716061  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  29.77 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  30.94 
 
 
155 aa  74.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  38.66 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  30.16 
 
 
162 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.76 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  36.7 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
161 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>