More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21870 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  77.85 
 
 		 149 aa  233  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  69.33 
 
 		 182 aa  205  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  73.24 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  68.53 
 
 		 143 aa  202  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  68.49 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 168 aa  194  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  66.44 
 
 		 165 aa  194  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  65.54 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  64.38 
 
 		 156 aa  189  9e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  61.38 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  68.89 
 
 		 136 aa  180  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  61.97 
 
 		 149 aa  177  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  65.25 
 
 		 161 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 		 156 aa  158  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 159 aa  153  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  52.48 
 
 		 152 aa  140  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  47.95 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  45.83 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 167 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  45.52 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.76 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  42.66 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 153 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 170 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 170 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.68 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 175 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 149 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 179 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  38.84 
 
 		 166 aa  92  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.93 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 167 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 174 aa  87.8  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 174 aa  87  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 		 154 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 		 156 aa  87  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  36.81 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  36.3 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  40.85 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 163 aa  84.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 174 aa  84.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  38.36 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  84.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  36.69 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.9 
 
 		 162 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  40.44 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 174 aa  83.6  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  38.13 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  43.7 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  36.69 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.17 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.03 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  35.97 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2967  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  37.1 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0046  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1634  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.865012  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  32.61 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3402  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.180052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>