More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0910 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  52.33 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  48.3 
 
 		 174 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  48.72 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  43.31 
 
 		 167 aa  141  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  43.08 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 149 aa  97.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 151 aa  93.6  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  91.7  6e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  88.6  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 162 aa  87.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 152 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  39.01 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.86 
 
 		 152 aa  85.5  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  37.67 
 
 		 155 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 147 aa  85.5  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 157 aa  84.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.76 
 
 		 158 aa  84.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 152 aa  84.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4756  AsnC family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  36.29 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  38.84 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  38.84 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  34.01 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4782  transcriptional regulator, AsnC family  37.9 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0537055 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  35.78 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.88 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  35.51 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.15 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4847  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4348  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328152  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.68 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.79 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.14 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  34.92 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7362  AsnC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0360859  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.39 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4183  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  34.46 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  34.46 
 
 		 164 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.03 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>