More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01670 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  70.51 
 
 
156 aa  241  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  48.08 
 
 
157 aa  165  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  50.65 
 
 
155 aa  161  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  48.98 
 
 
156 aa  156  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  48.97 
 
 
158 aa  148  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.14 
 
 
153 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  44.22 
 
 
155 aa  142  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.62 
 
 
153 aa  141  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.83 
 
 
153 aa  141  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.83 
 
 
164 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.83 
 
 
164 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.83 
 
 
164 aa  141  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  44.14 
 
 
164 aa  140  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
153 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
153 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  43.45 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.07 
 
 
153 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.07 
 
 
153 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.07 
 
 
153 aa  135  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  45.89 
 
 
150 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
153 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.07 
 
 
153 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.47 
 
 
153 aa  133  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.76 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.76 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40.13 
 
 
154 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
156 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.76 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  41.33 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  42.07 
 
 
153 aa  127  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  40.69 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  40 
 
 
154 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  38.3 
 
 
160 aa  110  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
150 aa  107  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 
149 aa  107  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  36.54 
 
 
153 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  40.14 
 
 
148 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 
168 aa  105  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
159 aa  105  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
159 aa  97.1  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
158 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
161 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
154 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.36 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
168 aa  90.9  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
157 aa  91.3  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
170 aa  89  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3744  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.01077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 
156 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
172 aa  87.8  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
184 aa  87.4  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0942  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
196 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
181 aa  85.1  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6457  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
158 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.545436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  84.3  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
162 aa  84  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
154 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  32.19 
 
 
167 aa  84  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  29.61 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  30.5 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8543  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0790  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000596151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0830  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000937972  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
155 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>