More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2274 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
136 aa  273  4e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  83.09 
 
 
147 aa  231  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  77.21 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  76.47 
 
 
182 aa  210  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  75 
 
 
158 aa  204  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  73.48 
 
 
150 aa  197  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  70.37 
 
 
149 aa  191  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
168 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  66.92 
 
 
158 aa  181  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  68.89 
 
 
151 aa  180  7e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  65.65 
 
 
149 aa  179  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  66.92 
 
 
165 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  63.7 
 
 
156 aa  175  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  66.17 
 
 
161 aa  160  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  57.25 
 
 
150 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  62.6 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  62.6 
 
 
166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  59.09 
 
 
156 aa  150  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  58.02 
 
 
156 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  56.82 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  61.83 
 
 
160 aa  143  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  55.73 
 
 
159 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  52.63 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  48.46 
 
 
153 aa  122  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  47.29 
 
 
144 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  50.76 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.03 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  46.62 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 
152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  42.54 
 
 
152 aa  107  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 
157 aa  92.8  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  43.38 
 
 
175 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40.91 
 
 
153 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 
153 aa  90.5  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.15 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 
151 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
170 aa  89.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.64 
 
 
153 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.37 
 
 
158 aa  87.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 
162 aa  87  7e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  41.07 
 
 
166 aa  87  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  35.61 
 
 
158 aa  85.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  44.27 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 
161 aa  84.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 
151 aa  84  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  44.03 
 
 
151 aa  84  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
162 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  37.12 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  36.57 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  36.57 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  36.64 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.17 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.58 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  37.14 
 
 
165 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
153 aa  80.1  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 
145 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  39.23 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  38.89 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.2 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  39.57 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.57 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 
164 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40 
 
 
153 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  39.45 
 
 
159 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  35.16 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.04 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  38.1 
 
 
167 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  39.39 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>