More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9337 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
153 aa  302  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  68.28 
 
 
151 aa  203  8e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  67.57 
 
 
151 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  64.58 
 
 
166 aa  173  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  50.68 
 
 
186 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  49.66 
 
 
175 aa  137  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
167 aa  121  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  42.96 
 
 
179 aa  117  7.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
153 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 
152 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.75 
 
 
152 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 
152 aa  100  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  40.38 
 
 
158 aa  99.4  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 
161 aa  99  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 
155 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
149 aa  94  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
143 aa  91.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
154 aa  90.5  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  33.1 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.81 
 
 
151 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  36.99 
 
 
148 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
182 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
157 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 
152 aa  85.5  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
155 aa  84.7  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
151 aa  84  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 
136 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 
149 aa  84  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 
159 aa  83.6  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.16 
 
 
152 aa  83.6  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
152 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  33.99 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  34.84 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  29.66 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3107  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.515902  hitchhiker  0.0000662993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  35.14 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.76 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  35 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  35 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 
147 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.29 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5075  AsnC family transcriptional regulator  33.87 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370147  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02081  transcription regulator protein  35.42 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 
168 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  34.29 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.29 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
152 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.82 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  31.29 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.61 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.29 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 
156 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.14 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0631  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.185529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
171 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  39.58 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>