More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6172 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 167 aa  337  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  53.79 
 
 		 192 aa  169  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3194  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2096  AsnC/Lrp family regulatory protein  54.29 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166489  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2237  AsnC family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 168 aa  154  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  52.17 
 
 		 145 aa  150  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17820  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  49.01 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  43.57 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3244  transcriptional regulator, AsnC family  41.33 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5771  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 		 240 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.647844  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4128  AsnC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 162 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4443  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.270446 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 181 aa  91.3  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 153 aa  90.9  8e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  32.88 
 
 		 149 aa  90.9  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0705  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  33.99 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 155 aa  87.8  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 157 aa  87.4  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3448  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0711543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 164 aa  85.1  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1428  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.92008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 170 aa  84.3  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2419  AsnC family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal  0.408785 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  31.54 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2037  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 158 aa  84.3  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0190388 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 157 aa  84  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 161 aa  84  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  30.72 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  34.25 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  34.25 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  34.25 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  37.32 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  34.25 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3847  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  32.89 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  28.86 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0723  proline dehydrogenase transcriptional activator  31.43 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  37.04 
 
 		 291 aa  80.9  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  32.47 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3118  AsnC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  37.09 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1629  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00470119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3320  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0097323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  30.87 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0945  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.962352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.54 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4324  transcriptional regulator AsnC family  32.64 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0666799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0586  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0941  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344592  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1065  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  33.56 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1024  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3495  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  33.56 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  33.56 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  33.56 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  29.68 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  27.74 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2171  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  38.19 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.155248  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  32.21 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>