More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7459 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  299  7.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  54.42 
 
 		 149 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.44 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  38.84 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.69 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.27 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  34.29 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  31.93 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.62 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.93 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  33.88 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  32.52 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 175 aa  76.6  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  32.77 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  33.05 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0017  HTH-type transcriptional regulator LrpB  31.36 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 152 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  33.05 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  33.05 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  33.05 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  33.06 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  31.71 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  31.09 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  33.77 
 
 		 174 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.91 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.26 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.38 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  30.89 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  30.89 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  37.1 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5229  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5630  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00107308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 		 159 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4179  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  31.08 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.65 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2239  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0015  HTH-type transcriptional regulator LrpB  30.25 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  30.58 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48000  leucin responsive regulatory protein  31.4 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.964771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  30.58 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  30.58 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>