More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0952 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  82.18 
 
 		 174 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  82.18 
 
 		 174 aa  302  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  81.03 
 
 		 174 aa  298  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  80.46 
 
 		 175 aa  298  4e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  79.31 
 
 		 174 aa  296  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  79.89 
 
 		 174 aa  296  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  49.67 
 
 		 167 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 153 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 150 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 150 aa  91.3  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07108  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 161 aa  90.5  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 152 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 159 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1843  bkd operon transcriptional regulator  32.89 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00082559  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0513  bkd operon transcriptional regulator  32.89 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000170709  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1736  bkd operon transcriptional regulator  32.89 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00397839  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1635  bkd operon transcriptional regulator  32.89 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000232797  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  41.26 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 		 151 aa  88.6  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  31.08 
 
 		 153 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2323  AsnC family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 152 aa  87.8  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  35.07 
 
 		 143 aa  87.8  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 153 aa  87.8  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0174  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 160 aa  87.8  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  37.41 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  37.41 
 
 		 164 aa  87.8  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  87.8  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0782  bkd operon transcriptional regulator  32.89 
 
 		 229 aa  87.4  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000164018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 153 aa  87.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2461  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000130465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  36.96 
 
 		 158 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  33.33 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3961  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.537786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001024  PutR transcriptional activator of PutA and PutP  28.66 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4400  transcriptional regulator BkdR  31.33 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1454  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.283041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 145 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1165  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.403646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 144 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 162 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0671  bkd operon transcriptional regulator  32.24 
 
 		 229 aa  85.5  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000013017  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1288  AsnC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  34.31 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  32.03 
 
 		 173 aa  84.7  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3741  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 161 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.641496  normal  0.623498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 163 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 163 aa  84.3  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3311  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944983  normal  0.0543443 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35540  transcriptional regulator BkdR  29.17 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.526091  hitchhiker  0.000450665 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  33.96 
 
 		 157 aa  84  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6217  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.662862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  30.97 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  28.47 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  35.2 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  29.73 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  33.58 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  30.32 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  32.61 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 171 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1064  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  32.17 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  38.73 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.591707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>