More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5321 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  68.31 
 
 		 182 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  66.9 
 
 		 158 aa  194  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  64.08 
 
 		 150 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  66.19 
 
 		 143 aa  192  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  63.38 
 
 		 156 aa  190  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  62.68 
 
 		 147 aa  186  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  62.68 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  65.65 
 
 		 136 aa  179  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  61.97 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 168 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.15 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  54.73 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  55.71 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  49.33 
 
 		 152 aa  144  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 166 aa  145  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  48.25 
 
 		 156 aa  133  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  46.05 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  43.88 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  47.97 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 		 152 aa  126  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  46.43 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  45.07 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  40.43 
 
 		 175 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  35.66 
 
 		 164 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  36.73 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.26 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 153 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 170 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  40.8 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4632  transcriptional regulator, AsnC family  40.5 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0402571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5293  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.848277  normal  0.172988 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 		 154 aa  92  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 186 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  41.78 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 155 aa  90.5  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3904  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.674127 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 148 aa  89.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.33 
 
 		 144 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4595  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 161 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 174 aa  88.6  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9337  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1293  AsnC family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 		 146 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  36.17 
 
 		 166 aa  87  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 174 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  32.39 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0598  AsnC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1531  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  35.71 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  35 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>