More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1645 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  89.94 
 
 		 159 aa  262  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  85.62 
 
 		 160 aa  238  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  78.38 
 
 		 150 aa  232  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  80.26 
 
 		 166 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  80.26 
 
 		 166 aa  221  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 		 151 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  57.75 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  57.75 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  59.57 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  53.96 
 
 		 143 aa  153  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  54.23 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  58.02 
 
 		 136 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  54.93 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  52.82 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  50.7 
 
 		 149 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 150 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  54.29 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  50 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  48.03 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.76 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  39.31 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 167 aa  97.1  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 145 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  35.17 
 
 		 152 aa  94  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 154 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 145 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  90.1  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  34.29 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.36 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 144 aa  87.8  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 170 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 170 aa  87  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  37.21 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 		 150 aa  84  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 162 aa  84  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  36.5 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  34.04 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4392  AsnC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.06 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.27 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  36.43 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2461  leucine-responsive transcriptional regulator  37.9 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000018296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  31.16 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35.97 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  33.55 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  32.89 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  34.27 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  37.7 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.21 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>