More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1646 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 154 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  99.35 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  98.05 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  98.7 
 
 		 154 aa  295  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  92.16 
 
 		 295 aa  282  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  92.81 
 
 		 193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  92.81 
 
 		 193 aa  281  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  92.81 
 
 		 153 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  92.81 
 
 		 153 aa  280  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1244  AsnC family transcriptional regulator  86 
 
 		 152 aa  262  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  84.21 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5153  AsnC family transcriptional regulator  69.01 
 
 		 153 aa  199  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4819  AsnC family transcriptional regulator  65.33 
 
 		 153 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  64.67 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 153 aa  194  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  64 
 
 		 153 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4666  helix-turn-helix, Fis-type  65.77 
 
 		 153 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0519  transcriptional regulator, AsnC family  64.79 
 
 		 146 aa  187  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81189  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  57.75 
 
 		 153 aa  167  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 164 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 149 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 151 aa  156  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  54.3 
 
 		 169 aa  153  7e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2036  AsnC family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 150 aa  140  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.279903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1845  transcriptional regulator, AsnC family  54.14 
 
 		 148 aa  140  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  49.3 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  43.8 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1937  AsnC family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3713  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  47.45 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0596  AsnC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 149 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 143 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 152 aa  103  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  41.73 
 
 		 145 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3493  AsnC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98557  normal  0.0180789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 143 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  43.17 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0119  AsnC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000436  transcriptional regulator  33.11 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.183617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1252  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.244343  normal  0.0514931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 140 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3770  AsnC family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 140 aa  87  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05858  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 150 aa  87  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  34.07 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 155 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 155 aa  84.3  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3545  AsnC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696559  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1326  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.323445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4079  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0278  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.421168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3029  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.698744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  30.28 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2801  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1404  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4281  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0614  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  33.82 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4836  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>