More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1958 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  53.38 
 
 		 161 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  47.02 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  51.01 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2858  transcriptional regulator, AsnC family  50.34 
 
 		 154 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000458938  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  36.42 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.18 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 162 aa  106  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  36.31 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 		 143 aa  103  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.97 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  37.24 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3479  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.623546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0882  transcriptional regulator, AsnC family  39.61 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0800  putative leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338493  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1764  putative leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1595  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1107  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 164 aa  99.4  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.43946  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.41 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0665  putative leucine-responsive regulatory protein  38.41 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.377599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  39.46 
 
 		 167 aa  99  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2393  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.271  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3749  AsnC family transcriptional regulator  38 
 
 		 181 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.648242 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 152 aa  98.6  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1184  bkd operon transcriptional regulator  38.41 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 152 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 182 aa  97.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 153 aa  97.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 170 aa  97.1  8e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2726  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 		 174 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 155 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3209  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0270  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5540  transcriptional regulator, AsnC family  36.75 
 
 		 203 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2221  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1709  transcriptional regulator, AsnC family  37.25 
 
 		 172 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.741571  normal  0.587028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0193  transcriptional regulator, AsnC family  37.66 
 
 		 161 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.740343  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0512  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 155 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3052  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1396  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 174 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4924  putative AsnC/lsr family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.459173  normal  0.0801597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 153 aa  94  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4270  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.34453  normal  0.84826 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2477  putative leucine-responsive regulatory protein  42.86 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.728563 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1555  regulatory protein AsnC/Lrp family  34.67 
 
 		 156 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.469049 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4941  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 154 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.342761  normal  0.28224 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 155 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1115  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 164 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.266621 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 151 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1672  AsnC family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 157 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198787  normal  0.483706 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  35.81 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  35.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  35.33 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 176 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4500  AsnC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699014  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2022  AsnC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 165 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0165  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00375326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>