More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2259 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 149 aa  297  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  77.85 
 
 		 151 aa  233  6e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  72.48 
 
 		 182 aa  220  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  71.63 
 
 		 143 aa  215  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  71.53 
 
 		 158 aa  205  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  68.53 
 
 		 158 aa  203  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  65.75 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  63.45 
 
 		 156 aa  194  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 168 aa  193  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 147 aa  192  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  63.19 
 
 		 150 aa  189  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 150 aa  178  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  65.96 
 
 		 161 aa  177  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  59.86 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  58.04 
 
 		 156 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  55.63 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 159 aa  152  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  46.48 
 
 		 144 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  46.53 
 
 		 153 aa  126  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 		 152 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4616  transcriptional regulator, AsnC family  46.26 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.527388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  38.78 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  43.97 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0910  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 179 aa  97.4  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 170 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  33.57 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 161 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.16 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  40.16 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  38.62 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 157 aa  88.6  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  35.17 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  35.17 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 162 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  39.37 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0924  leucine-responsive regulatory protein  35.95 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0407  leucine-responsive regulatory protein  35.95 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5660  AsnC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0223  leucine-responsive regulatory protein  35.95 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.396703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2550  leucine-responsive regulatory protein  35.95 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.678942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  31.76 
 
 		 158 aa  87.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 173 aa  87  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 		 162 aa  87  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.6 
 
 		 153 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  37.32 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 186 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3724  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201895  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2836  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 		 165 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  38.3 
 
 		 164 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4644  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 		 168 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2995  transcriptional regulator BkdR  37.1 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>