More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13320 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  297  4e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1271  AsnC family transcriptional regulator  83.56 
 
 
166 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1288  AsnC family transcriptional regulator  83.56 
 
 
166 aa  228  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  78.38 
 
 
156 aa  220  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  80.82 
 
 
160 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  76.03 
 
 
159 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  61.38 
 
 
151 aa  180  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  59.15 
 
 
149 aa  178  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 
182 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.15 
 
 
165 aa  167  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  55.4 
 
 
143 aa  166  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 
168 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  56.34 
 
 
158 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  54.79 
 
 
156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 
147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01030  transcriptional regulator, AsnC family  56.74 
 
 
152 aa  159  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 
149 aa  157  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  53.42 
 
 
158 aa  157  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  54.93 
 
 
150 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2696  transcriptional regulator, AsnC family  57.14 
 
 
161 aa  155  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  57.25 
 
 
136 aa  152  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1426  transcriptional regulator  51.77 
 
 
144 aa  140  7e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  47.66 
 
 
156 aa  133  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0112  transcriptional regulator, AsnC family  47.86 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 
152 aa  108  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  42.28 
 
 
167 aa  103  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 
156 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  42.25 
 
 
170 aa  100  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
153 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
170 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  40.85 
 
 
170 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  40.88 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.43 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4510  AsnC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
152 aa  94.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.93 
 
 
152 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  39.01 
 
 
149 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  35 
 
 
144 aa  92  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 
145 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.91 
 
 
156 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
161 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
186 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1742  leucine-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 
166 aa  84.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  41.32 
 
 
164 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  84  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  38.46 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.46 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
162 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  40.5 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  39.67 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2044  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549903  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  39.67 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1494  leucine-responsive transcriptional regulator  38.24 
 
 
164 aa  82  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000974852  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  41.32 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  36.62 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01796  leucine-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  37.78 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  40.5 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  39.02 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  39.02 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  39.67 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  39.02 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
162 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.13 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003880  leucine-responsive regulatory protein  36.96 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000693258  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  39.17 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.5 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 
174 aa  80.5  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
151 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>