More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3874 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  293  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  95.17 
 
 		 145 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  95.17 
 
 		 145 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  93.79 
 
 		 145 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 145 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  86.11 
 
 		 145 aa  253  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  82.76 
 
 		 145 aa  247  5e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  83.33 
 
 		 164 aa  246  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  66.2 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  66.2 
 
 		 150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  67.61 
 
 		 154 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 145 aa  187  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 163 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  66.9 
 
 		 154 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 162 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  59.15 
 
 		 162 aa  176  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 163 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 163 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 162 aa  176  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  59.86 
 
 		 162 aa  176  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 153 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  54.23 
 
 		 149 aa  165  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  63.64 
 
 		 156 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  57.04 
 
 		 163 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  50 
 
 		 153 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  41.55 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  35 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 160 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 153 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 170 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  96.7  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  95.9  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  39.13 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  36.5 
 
 		 152 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 151 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  34.59 
 
 		 151 aa  94  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 157 aa  94.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 151 aa  93.6  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  35.82 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  32.41 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  33.58 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1645  AsnC family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.13365  normal  0.462855 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  35.56 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  35.56 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4797  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.099377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 174 aa  88.6  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1298  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 160 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408697  normal  0.183979 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 		 175 aa  87.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  32.87 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 174 aa  87  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  37.78 
 
 		 174 aa  87.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  33.85 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  33.85 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  33.85 
 
 		 150 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.56 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  84.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 173 aa  84.3  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>