More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2206 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
147 aa  303  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  54.74 
 
 
150 aa  163  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  54.01 
 
 
150 aa  160  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  51.05 
 
 
150 aa  159  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  51.05 
 
 
150 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 
171 aa  158  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 
150 aa  158  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 
171 aa  158  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 
150 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  50.35 
 
 
150 aa  158  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
150 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  49.65 
 
 
150 aa  158  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2309  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.85 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.04 
 
 
153 aa  102  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  38.97 
 
 
155 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  32.59 
 
 
152 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
153 aa  96.7  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  35.11 
 
 
144 aa  95.9  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
173 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
170 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 
167 aa  94  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 
165 aa  92.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  35.61 
 
 
164 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  33.59 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
159 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
170 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
145 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
170 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  32.82 
 
 
154 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  36.03 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  36 
 
 
155 aa  91.3  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2686  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 
164 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.247423  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2597  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 
164 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282665  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1612  leucine-responsive transcriptional regulator  34.67 
 
 
164 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000163573  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
162 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 
148 aa  90.5  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
152 aa  90.1  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
160 aa  88.6  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  38.52 
 
 
176 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  32.86 
 
 
155 aa  89  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  30.83 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  33.6 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
151 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  32.17 
 
 
145 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1058  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000658641  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0993  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1024  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000719526  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000969196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1073  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000166195  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00893  DNA-binding transcriptional dual regulator, leucine-binding  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2754  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2439  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000889772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1051  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000229844  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2707  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000640359  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0994  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000266294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0964  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000271902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00900  hypothetical protein  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2231  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000028804  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1413  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000135875  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  29.32 
 
 
151 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  34.4 
 
 
159 aa  87  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 
151 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1682  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.94162  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  33.56 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30.99 
 
 
157 aa  85.5  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
170 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  32.33 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  32.8 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  33.59 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  31.58 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.89 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  36.89 
 
 
175 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  29.1 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  29.22 
 
 
158 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  38.35 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>