More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0920 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  71.62 
 
 		 157 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 148 aa  189  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 148 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  64.75 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.86 
 
 		 187 aa  180  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  61.81 
 
 		 159 aa  179  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  55.94 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  48.67 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 153 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  43.26 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.01 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.44 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  42.45 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  42.55 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  42.45 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 160 aa  100  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  43.36 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  38.51 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  44.6 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 153 aa  99.4  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  37.96 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 151 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  37.68 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  37.68 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  33.78 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 162 aa  91.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  39.26 
 
 		 165 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 173 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  44.76 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  43.33 
 
 		 176 aa  87  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 173 aa  87  7e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 163 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  42.5 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  42.5 
 
 		 175 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0443  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  35 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 163 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  40.41 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  40.56 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 182 aa  84  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 167 aa  83.6  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2906  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 168 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7984  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  39.19 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2113  AsnC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.264729  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2835  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>