More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1625 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 159 aa  199  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  63.7 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  60.14 
 
 		 187 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 149 aa  189  9e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  61.81 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  58.27 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  52.52 
 
 		 149 aa  144  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 153 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 170 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 170 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 170 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  43.38 
 
 		 155 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  43.38 
 
 		 155 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.88 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  37.76 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  40.74 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 173 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  37.41 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 164 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  38.85 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 167 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  37.68 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 		 158 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 153 aa  94.4  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  39.29 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  40.29 
 
 		 157 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  34.75 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  34.75 
 
 		 164 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  33.83 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  33.08 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 151 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 151 aa  84.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  38.3 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  31.58 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 		 172 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 163 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  32.35 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 163 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  29.41 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 148 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 149 aa  78.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  27.94 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 146 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  28.68 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0571  transcriptional regulator, AsnC family  47.52 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  30.88 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>