More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04777 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  100 
 
 		 164 aa  330  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  42.86 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  42.75 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 151 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  43.38 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 170 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  43.7 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 173 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  36.69 
 
 		 151 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 160 aa  101  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  38.19 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 		 150 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  35.97 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 150 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  40.3 
 
 		 155 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 151 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  37.41 
 
 		 152 aa  98.2  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 159 aa  97.1  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.5 
 
 		 187 aa  94.4  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  41.13 
 
 		 149 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  41.3 
 
 		 167 aa  92  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  92  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  34.06 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 145 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 174 aa  90.9  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 163 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 163 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 145 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.14 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 153 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 		 141 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 174 aa  87.8  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  87.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 168 aa  86.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  35.25 
 
 		 159 aa  86.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  33.33 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 171 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 161 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  34.56 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 		 175 aa  85.1  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  34.59 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.23 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 		 165 aa  84.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2941  transcriptional regulator, AsnC family  36.43 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000077861  hitchhiker  0.000100592 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>