More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0634 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
162 aa  330  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  46.45 
 
 
157 aa  144  6e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
153 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
170 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
170 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  42.66 
 
 
153 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  44.78 
 
 
151 aa  124  5e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 
162 aa  124  6e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  47.48 
 
 
156 aa  124  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  44.06 
 
 
152 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
151 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  44.78 
 
 
151 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  43.28 
 
 
151 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  44.2 
 
 
151 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  44.37 
 
 
158 aa  120  6e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  45.99 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  42.67 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  40.91 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  43.28 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  41.79 
 
 
145 aa  114  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  48.18 
 
 
153 aa  114  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.86 
 
 
157 aa  114  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  40.74 
 
 
141 aa  114  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  35.26 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  44.93 
 
 
162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
167 aa  111  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.67 
 
 
187 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  41.98 
 
 
159 aa  110  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  38.06 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  39.85 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  41.79 
 
 
145 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3073  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
146 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0379394  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3294  transcriptional regulator, AsnC family  35.62 
 
 
146 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3316  AsnC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
146 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  40.97 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
149 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0267  transcriptional regulator, AsnC family  43.88 
 
 
149 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.481188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  43.26 
 
 
164 aa  103  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  43.7 
 
 
168 aa  103  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  41.96 
 
 
165 aa  103  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  38.81 
 
 
158 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
144 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
173 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  39.13 
 
 
155 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
155 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  37.23 
 
 
155 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
157 aa  101  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2928  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
146 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  45.65 
 
 
153 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  43.57 
 
 
167 aa  100  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  34.75 
 
 
164 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  34.75 
 
 
164 aa  100  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2980  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
146 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00205461  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2972  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  34.56 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2042  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
146 aa  100  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
150 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3205  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
146 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00222041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3196  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3214  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
146 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3240  transcriptional regulator, AsnC family  33.82 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.47517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2907  AsnC family leucine-responsive regulatory protein  33.82 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5348  transcriptional regulator, AsnC family  37.16 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  37.58 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
153 aa  98.2  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  36.88 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
151 aa  97.4  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.96 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  38.06 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
163 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1625  AsnC family transcriptional regulator  34.64 
 
 
148 aa  95.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  35.56 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  37.88 
 
 
155 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0100  leucine-responsive regulatory protein  37.68 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0244  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  35.04 
 
 
174 aa  94.4  6e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  40.97 
 
 
152 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
160 aa  94  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  40.58 
 
 
152 aa  94.4  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6082  leucine-responsive regulatory protein  36.96 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70080  leucine-responsive regulatory protein  36.96 
 
 
162 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.68 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1356  transcriptional regulator, AsnC family  41.73 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.272090000000001e-29 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  37.68 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03072  leucine responsive regulatory protein  37.68 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  92.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5527  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
162 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
174 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>