More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2863 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  78.53 
 
 
164 aa  259  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  75.32 
 
 
168 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  74.03 
 
 
165 aa  236  8e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 
170 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  44.87 
 
 
170 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
170 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
153 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  46.21 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  45.52 
 
 
153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  44.6 
 
 
151 aa  114  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  42.22 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40.82 
 
 
157 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  45.64 
 
 
153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
152 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.93 
 
 
160 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  34.94 
 
 
165 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  37.32 
 
 
145 aa  105  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
153 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0128  transcription regulator protein  41.06 
 
 
152 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  41.43 
 
 
156 aa  104  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  41.04 
 
 
157 aa  103  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  39.26 
 
 
151 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
173 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  42.96 
 
 
158 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  45.86 
 
 
162 aa  103  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 
167 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2318  transcription regulator protein  39.85 
 
 
151 aa  101  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.623909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
152 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  39.55 
 
 
151 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
150 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  41.26 
 
 
150 aa  100  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
163 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  38.81 
 
 
151 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  98.2  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
153 aa  97.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
160 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
145 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  35.51 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6058  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1469  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  96.3  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  39.16 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  37.59 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4570  putative transcriptional regulator, AsnC family  39.1 
 
 
151 aa  94  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411943  normal  0.0415278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0144  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
148 aa  94  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.314289 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  36.43 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  36.43 
 
 
164 aa  93.2  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3532  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.77 
 
 
187 aa  93.2  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  91.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  38.19 
 
 
155 aa  91.3  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6249  putative transcriptional regulator, AsnC family  37.86 
 
 
141 aa  90.5  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358663  normal  0.0293098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  36.3 
 
 
154 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  89.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0920  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
149 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000737241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  40.74 
 
 
163 aa  89  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 
163 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  41.67 
 
 
154 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 
163 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 
163 aa  89  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2660  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
150 aa  89  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0584883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  38.36 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.99 
 
 
162 aa  88.2  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  36.3 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.91 
 
 
152 aa  88.2  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
162 aa  87.8  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
161 aa  87.8  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 
152 aa  87.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 
159 aa  87.4  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2300  AsnC family transcriptional regulator  34.48 
 
 
145 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0611064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2905  Lpr/AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
144 aa  87  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000783053  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0129  transcriptional regulator, AsnC family  37.31 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  40.65 
 
 
156 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
156 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
156 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  28.17 
 
 
149 aa  85.5  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  36.69 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4446  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.386761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
152 aa  84.7  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
145 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  38.89 
 
 
153 aa  85.1  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  36.67 
 
 
167 aa  84.7  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
169 aa  84.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5506  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63240  putative transcriptional regulator  34.81 
 
 
155 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  37.84 
 
 
156 aa  84.3  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
145 aa  84.3  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2886  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 
156 aa  84  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  34.33 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4090  AsnC/Lrp family regulatory protein  35.42 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>