More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0270 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0159  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4344  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 154 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.339473  normal  0.745241 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0348  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 162 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0538  transcription regulator AsnC  56.64 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0360  AsnC family transcriptional regulator  56.64 
 
 		 162 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 163 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4406  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0309  transcription regulator AsnC  54.55 
 
 		 162 aa  157  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4296  transcriptional regulator, AsnC family  53.15 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3635  AsnC family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.645135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  52.08 
 
 		 164 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6313  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0434  transcriptional regulator, AsnC family  58.87 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 145 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2349  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2984  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2963  AsnC family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 149 aa  146  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4609  transcriptional regulator, AsnC family  52.45 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.466544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1519  AsnC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504276  normal  0.158114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.97 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2008  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.286452  normal  0.455771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 162 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  35.97 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  35.97 
 
 		 164 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 170 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1414  transcriptional regulator, AsnC family  36.09 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1084  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1479  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 171 aa  94  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  36.11 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 		 157 aa  94  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1250  AsnC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000276416  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1521  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1452  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.281827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3929  transcriptional regulator, AsnC family  35.34 
 
 		 150 aa  93.6  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1278  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.37198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1252  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 171 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.173274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1380  AsnC family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  36.62 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1285  AsnC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.026588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 149 aa  91.3  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2134  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3569  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.519429  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1645  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0624735  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  32.17 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  40.16 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.06 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1330  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 		 151 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180396  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0785  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1161  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.012634 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1230  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2206  transcriptional regulator, AsnC family  34.62 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1950  AsnC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  33.8 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  26.95 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  34.33 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  35.29 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  36.03 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  31.94 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  37.9 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1321  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  35.42 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>