More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1355 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
152 aa  293  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  78.23 
 
 
152 aa  216  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  42.21 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  44.3 
 
 
154 aa  121  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  44.93 
 
 
152 aa  120  5e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 
153 aa  120  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  41.61 
 
 
152 aa  118  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  40.27 
 
 
154 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  45.71 
 
 
151 aa  111  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  40.52 
 
 
153 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  35.51 
 
 
151 aa  87  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  34.51 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  40.16 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2378  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
168 aa  77.8  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258345  hitchhiker  0.0022466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  37.14 
 
 
156 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2259  AsnC/Lrp family regulatory protein  37.41 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.25142  normal  0.0557918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  34.51 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4016  AsnC family transcriptional regulator  31.76 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0056672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2356  AsnC family transcriptional regulator  33.78 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0125137 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  42.45 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  31.69 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2105  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.166182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2151  AsnC family transcriptional regulator  29.53 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.132892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  31.37 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  41.03 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  40.57 
 
 
171 aa  73.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
181 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1444  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
156 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2088  AsnC family transcriptional regulator  28.86 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.61 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  37.01 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  31.03 
 
 
146 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  34.19 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  37.72 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  34.19 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  40 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  40 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  34.78 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1744  transcriptional regulator, AsnC family  32.65 
 
 
169 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2489  AsnC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132584  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  37.4 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0320  transcriptional regulator, AsnC family  38.41 
 
 
152 aa  71.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102838  normal  0.0238035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  42.72 
 
 
162 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4624  AsnC family transcriptional regulator  35.46 
 
 
153 aa  72  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3205  AsnC family transcriptional regulator  32.88 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2959  AsnC family transcriptional regulator  45.1 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 
170 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3951  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
174 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  33.56 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  31.72 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  36.89 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37580  putative leucine-responsive regulatory protein  32.88 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.777021  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4045  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0883438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0006  transcriptional regulator, AsnC family  30.57 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1454  AsnC family transcriptional regulator  30.97 
 
 
160 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2879  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  51.47 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4608  transcriptional regulator, AsnC family  30.72 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.343686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  33.81 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3379  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3154  AsnC/Lrp family regulatory protein  32.87 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140742  normal  0.198737 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3679  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
180 aa  70.1  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  36.52 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0221  putative transcriptional regulator, AsnC family  38.52 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00181954  hitchhiker  0.00407827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  35.2 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  33.1 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  35.07 
 
 
149 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1873  transcriptional regulator, AsnC family  39 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0036157  normal  0.0140014 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  30.67 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0907  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2653  putative leucine-responsive regulatory protein  39.25 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.326874  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  27.89 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  33.1 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  33.1 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1733  AsnC family transcriptional regulator  32.81 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.017814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4274  transcriptional regulator, AsnC family  34.01 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365421  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3204  transcriptional regulator, AsnC family  35.86 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10165  normal  0.976378 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  34.42 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2333  transcriptional regulator, AsnC family  31.85 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073767  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  33.1 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  34.27 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  36.54 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  30.52 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
168 aa  68.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>