More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2297 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
154 aa  308  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  87.58 
 
 
153 aa  271  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  83.01 
 
 
154 aa  258  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  77.63 
 
 
152 aa  246  6e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  76.97 
 
 
153 aa  239  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  75.16 
 
 
153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  74.34 
 
 
152 aa  234  3e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  52.14 
 
 
151 aa  147  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 
152 aa  120  9e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  40.56 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  35.66 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  42.31 
 
 
152 aa  107  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  25.85 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5004  transcriptional regulator, AsnC family  30.08 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.38701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  29.85 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2148  transcriptional regulator, AsnC family  27.03 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  24.31 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0270  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  23.68 
 
 
152 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1813  AsnC family transcriptional regulator  29.33 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401161  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  27.07 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2393  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2241  AsnC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.78571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5843  putative transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8338  putative transcriptional regulator, AsnC family  25.33 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00400  transcriptional regulator, AsnC family  27.78 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2639  putative transcriptional regulator  35 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30770  AsnC family transcriptional regulator  35 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000665736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5976  transcriptional regulator AsnC family  30.83 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  30.07 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  24.63 
 
 
146 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1522  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 
174 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115055  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  25.18 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2809  AsnC family transcriptional regulator  31.47 
 
 
164 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  27.21 
 
 
156 aa  61.6  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1435  AsnC family transcriptional regulator  30.61 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.855042  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21870  transcriptional regulator, AsnC family  28.77 
 
 
151 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16811  normal  0.0441488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  26 
 
 
174 aa  61.6  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
174 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  28.22 
 
 
167 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  23.78 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  23.74 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1462  AsnC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
150 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3954  AsnC family transcriptional regulator  27.15 
 
 
152 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2259  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000534286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  25.36 
 
 
162 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04777  transcription regulator protein  31.91 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05660  transcription regulator protein  31.91 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  24.67 
 
 
174 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1824  AsnC family transcriptional regulator  29.63 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.451696  normal  0.855056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  26.24 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3874  AsnC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2066  AsnC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6796  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615039  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  24.06 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4327  transcriptional regulator, AsnC family  24.65 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4308  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1559  AsnC family transcriptional regulator  36.56 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 
149 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0789  transcriptional regulator, AsnC family  24.81 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  25.37 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4845  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0710224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2838  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.12042  normal  0.0436846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4290  AsnC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1733  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1625  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  23.19 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0655  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5688  putative transcriptional regulator, AsnC family  32.63 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0161632  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0828  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  25.16 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  24.26 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  24.29 
 
 
162 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  26.79 
 
 
153 aa  57.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2541  AsnC family transcriptional regulator  29.52 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3553  AsnC family transcriptional regulator  29.77 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3942  AsnC family transcriptional regulator  29.52 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00978947  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3578  AsnC family transcriptional regulator  29.52 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322121  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1485  transcriptional regulator, AsnC family  26.52 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 
174 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0409  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5312  AsnC family transcriptional regulator  29.52 
 
 
143 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0527  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4242  AsnC family transcriptional regulator  25.53 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1770  AsnC family transcriptional regulator  25.68 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.137786  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
154 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0585  transcriptional regulator, AsnC family  27.82 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>