More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1358 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 
152 aa  290  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1355  transcriptional regulator, AsnC family  78.23 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.841958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0708  transcriptional regulator, AsnC family  47.26 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1538  transcriptional regulator, AsnC family  47.48 
 
 
152 aa  130  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.819004  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4777  transcriptional regulator, AsnC family  42.57 
 
 
153 aa  130  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126029  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1460  transcriptional regulator, AsnC family  45.27 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  44.59 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2297  transcriptional regulator, AsnC family  41.22 
 
 
154 aa  120  9e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0921  transcriptional regulator, AsnC family  44.29 
 
 
151 aa  114  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.287317  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  42.47 
 
 
153 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  34.53 
 
 
156 aa  89  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1670  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  34.25 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  35.06 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  35.21 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.37 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0356  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.131821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0810  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5136  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  35.77 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  39.2 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2899  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1068  leucine regulator  31.72 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000926215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  34.72 
 
 
156 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3278  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.882377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1009  regulator for leucine  31.72 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000013184  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1036  leucine regulator  31.72 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.923794  hitchhiker  0.000390599 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1101  regulator for leucine  31.72 
 
 
153 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2752  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4810  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.402994  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3357  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.773724  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  32.37 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4159  AsnC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
152 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.409138  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1679  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2647  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
159 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
163 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2140  transcriptional regulator, AsnC family  35.65 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.526818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0505  AsnC family transcriptional regulator  37.04 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.287922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5229  AsnC family transcriptional regulator  33.79 
 
 
152 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.104749  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3670  transcriptional regulator, AsnC family  31.45 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0025682  hitchhiker  0.0000000562652 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2240  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.971362  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0287  AsnC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.567695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2018  transcriptional regulator, AsnC family  40 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0609925  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1976  putative leucine-responsive regulatory protein  33.53 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.657079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3529  putative leucine-responsive regulatory protein  33.53 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3176  transcriptional regulator, AsnC family  32.68 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000000237369  hitchhiker  0.000000000657439 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  27.03 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1513  AsnC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
176 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3837  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3795  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
156 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102457  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  32.64 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0551  transcription regulator AsnC  33.79 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0374  leucine-responsive regulatory protein  33.79 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0361  leucine-responsive regulatory protein  33.79 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2581  leucine-responsive regulatory protein, putative  33.33 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3844  putative leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2452  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.591707 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0015  transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6006  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30036  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6802  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3105  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3783  putative leucine-responsive regulatory protein  33.33 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  36.44 
 
 
172 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0397  AsnC family transcriptional regulator  35.81 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41995 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4019  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.814285  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  31.72 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4231  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0970255  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3757  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349158  normal  0.199057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2865  AsnC family transcriptional regulator  32.7 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024774 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4348  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281114  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2209  AsnC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  31.76 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0022  transcriptional regulator, AsnC family  38.6 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1192  AsnC family transcriptional regulator  35.48 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0004  AsnC family transcriptional regulator  33.54 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1480  AsnC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3119  putative leucine-responsive regulatory protein  33.54 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.533929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>