More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0150 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
167 aa  333  5.999999999999999e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  47.86 
 
 
140 aa  143  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  47.14 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  45.77 
 
 
143 aa  127  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  45.71 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  46.43 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  47.14 
 
 
140 aa  122  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2846  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 
142 aa  92  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00639698  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2162  transcriptional regulator, AsnC family  37.21 
 
 
142 aa  89.7  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0104  transcriptional regulator, AsnC family  37.5 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274571  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1446  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
142 aa  84.7  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0889  transcriptional regulator, AsnC family  34.11 
 
 
142 aa  84  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.853519  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2379  transcriptional regulator, AsnC family  32.56 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19100  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000170576  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  30.88 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  30.58 
 
 
149 aa  77  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3008  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.213082  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  30.14 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.97 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1076  transcriptional regulator, AsnC family  30.43 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  30.07 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  30.22 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0408  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2148  transcriptional regulator, AsnC family  33.61 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.645827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1183  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 
167 aa  71.6  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  29.71 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  32.87 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2826  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3016  transcriptional regulator, AsnC family  34.35 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2373  transcriptional regulator, AsnC family  34.35 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455385  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0970  AsnC family transcriptional regulator  28.28 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1811  AsnC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
152 aa  70.9  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  30.71 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0384  AsnC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3907  AsnC family transcriptional regulator  34.92 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.960178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0412  AsnC family transcriptional regulator  31.69 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1358  transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 
152 aa  69.3  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542871  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31820  transcriptional regulator, AsnC family  33.06 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2275  AsnC/Lrp family regulatory protein  31.73 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.444267  normal  0.0654851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  28.33 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
148 aa  68.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.79 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0997  AsnC family transcriptional regulator  30.72 
 
 
167 aa  68.6  0.00000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.488133  normal  0.0113104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1958  transcriptional regulator, AsnC family  31.21 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0996907 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0849  AsnC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
167 aa  68.2  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4349  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  34.35 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  30.6 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  38.21 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  29.17 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.79 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.83 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  29.08 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  28.87 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.83 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  30.83 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1476  AsnC family transcriptional regulator  36.29 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0190904  normal  0.108555 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3210  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
161 aa  67  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0738  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.71 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1956  AsnC family transcriptional regulator  30.07 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  27.61 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2039  AsnC family transcriptional regulator  32.5 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.558444 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  27.64 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06945  probable transcription regulator protein  31.86 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0417  AsnC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0634  AsnC family transcriptional regulator  33.08 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1249  AsnC family transcriptional regulator  28.97 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518927  normal  0.957765 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  29.37 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1853  AsnC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.199579  normal  0.332251 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4172  AsnC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000168558  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  31.03 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  28.91 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5825  transcriptional regulator, AsnC family  25 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.269071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>