More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0893 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0893  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
171 aa  343  8.999999999999999e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.518321  normal  0.419267 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0951  AsnC/Lrp family regulatory protein  89.47 
 
 
171 aa  295  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  73.65 
 
 
161 aa  231  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  66.26 
 
 
165 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1552  transcriptional regulator, AsnC family  74.5 
 
 
159 aa  218  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1879  putative transcriptional regulator, AsnC family  69.59 
 
 
164 aa  217  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1494  transcriptional regulator, AsnC family  71.03 
 
 
162 aa  207  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  67.32 
 
 
173 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  65.97 
 
 
162 aa  203  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  66.44 
 
 
164 aa  202  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0284  transcriptional regulator, AsnC family  67.11 
 
 
168 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  66.01 
 
 
173 aa  200  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3779  AsnC family transcriptional regulator  67.36 
 
 
162 aa  197  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0157981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1727  transcriptional regulator, AsnC family  71.43 
 
 
165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.150794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1286  AsnC family transcriptional regulator  68.03 
 
 
164 aa  195  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00582005  normal  0.145241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  58.79 
 
 
162 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0574  transcriptional regulator, AsnC family  61.69 
 
 
184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0164952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  64.05 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  64.05 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  64.05 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  49.32 
 
 
163 aa  154  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2186  transcriptional regulator, AsnC family  46.15 
 
 
177 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0000790252  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3441  transcriptional regulator, AsnC family  36.55 
 
 
161 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000970629  normal  0.0913229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2732  AsnC family transcriptional regulator  38.36 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000010771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2748  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
148 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1420  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.11 
 
 
302 aa  87.4  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  34.48 
 
 
308 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1373  AsnC family transcriptional regulator  35.88 
 
 
360 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0159  AsnC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3332  AsnC family transcriptional regulator  36.72 
 
 
155 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4037  transcriptional regulator, AsnC family  36 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  33.57 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0354  transcriptional regulator, AsnC family  35.14 
 
 
338 aa  78.2  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  31.91 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  35.56 
 
 
137 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  35.04 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4074  transcriptional regulator, AsnC family  30.66 
 
 
291 aa  71.2  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  33.09 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  34.72 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  34.31 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2503  AsnC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  36.23 
 
 
137 aa  69.3  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0657  AsnC family transcriptional regulator  36.23 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.702777 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  29.01 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0150  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 
167 aa  67.8  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0872  transcriptional regulator, AsnC family  29.13 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000611849  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2914  transcriptional regulator, AsnC family  30.2 
 
 
192 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3735  AsnC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
134 aa  67  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.24 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
156 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 
155 aa  66.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5583  transcriptional regulator, AsnC family  34.23 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.24 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.24 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.74 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.24 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  28.24 
 
 
164 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.48 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  31.39 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0871  AsnC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.793792  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0888  AsnC family transcriptional regulator  28.66 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0877  AsnC family transcriptional regulator  29.75 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0402  transcriptional regulator, AsnC family  31.43 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  27.48 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.36 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.36 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  25.36 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1134  transcriptional regulator, AsnC family  34.21 
 
 
327 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0632  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.134943 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  24.31 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  32.52 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2937  AsnC family transcriptional regulator  30.66 
 
 
328 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  28.99 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2274  AsnC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
136 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321724  hitchhiker  0.000620833 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  25.98 
 
 
140 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  26.81 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  37.41 
 
 
153 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  24.31 
 
 
154 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  26.81 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14050  transcriptional regulator, AsnC family  34.68 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00148538  normal  0.352313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>