More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2805 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2805  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  324  4.0000000000000003e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10428  transcriptional regulator of asparagine biosynthesis (AsnC family)  83.54 
 
 		 160 aa  282  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1908  transcriptional regulator, AsnC family  57.86 
 
 		 168 aa  209  2e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0979  AsnC family transcriptional regulator  44 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.377349  normal  0.176227 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5148  transcriptional regulator, AsnC family  43.24 
 
 		 156 aa  127  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0544097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2721  transcriptional regulator, AsnC family  40.28 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.147044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4176  regulatory protein AsnC/Lrp family  41.96 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.22931  hitchhiker  0.00132391 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3982  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.06 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1625  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000585633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0782  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.99 
 
 		 153 aa  110  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0707861  hitchhiker  0.0088229 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4182  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.06 
 
 		 154 aa  110  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1906  AsnC family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.424603  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4536  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.06 
 
 		 153 aa  110  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.191553  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1012  transcriptional regulator, AsnC family  35.92 
 
 		 155 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4246  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.36 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0916  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.86 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.744158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0514  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.86 
 
 		 153 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3049  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.756059  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0737  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.42 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00257179  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3799  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3707  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00460133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3584  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01670  putative AsnC family regulatory protein  39.01 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3140  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0826  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00366565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3516  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300675  normal  0.271291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0820  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0118429 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0798  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.477515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0732  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0833  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0605  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.17 
 
 		 153 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.132523 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.97 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.402412  normal  0.678119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0002  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.97 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000470477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2443  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.36 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4215  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.97 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000923304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4121  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  34.93 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000888871  normal  0.0352311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4906  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.57 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000146848  hitchhiker  0.000490685 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001951  transcriptional regulator AsnC  37.06 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1127  AsnC family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4268  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.62 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.420279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4159  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.62 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0741698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4088  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.62 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0112845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00527  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  37.06 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4103  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.62 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038241  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4209  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  35.62 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.373389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1179  transcriptional regulator, AsnC family  37.23 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000178537 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1441  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  36.88 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4111  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 		 152 aa  95.1  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00357287  normal  0.0580039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03627  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0735302  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4224  transcriptional regulator, AsnC family  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4251  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0324749 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03571  hypothetical protein  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.108686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3959  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0277733  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4178  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0542256  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5179  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000121129  normal  0.124377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4259  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  33.56 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0444894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4658  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.870305  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2944  DNA-binding transcriptional regulator AsnC  31.47 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0448  AsnC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  32.24 
 
 		 153 aa  81.3  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0459  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.531028  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1531  AsnC family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1026  AsnC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0878761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1063  transcriptional regulator, AsnC family  29.29 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1534  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  29.93 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0972  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.109068  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0286  transcriptional regulator, AsnC family  28.97 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2273  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10540  transcriptional regulator, AsnC family  26.85 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0120082  normal  0.725639 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2085  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2141  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1646  AsnC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  27.54 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2673  AsnC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2305  AsnC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3882  AsnC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  30.15 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5021  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.933317  normal  0.0987272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0400  AsnC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1738  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.615742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1646  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1018  AsnC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336802  hitchhiker  0.00248451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0018  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 170 aa  72  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.443064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  28.17 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2050  AsnC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>