More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1170 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 
156 aa  310  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  76.19 
 
 
162 aa  221  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  65.28 
 
 
144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  60.14 
 
 
152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  60 
 
 
146 aa  174  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  58.33 
 
 
154 aa  174  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  59.44 
 
 
152 aa  174  5e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  59.44 
 
 
156 aa  173  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  56.25 
 
 
151 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  59.72 
 
 
156 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  55.94 
 
 
148 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5069  AsnC family transcriptional regulator  50.34 
 
 
156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12347  AsnC family transcriptional regulator  51.03 
 
 
148 aa  150  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.185579  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1289  AsnC family transcriptional regulator  50.69 
 
 
148 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.666293  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  50.69 
 
 
148 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  50.67 
 
 
163 aa  144  5e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  47.59 
 
 
149 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
148 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  51.39 
 
 
148 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  47.18 
 
 
148 aa  140  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  48.34 
 
 
154 aa  135  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  47.55 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4114  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  41.73 
 
 
144 aa  106  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  39.42 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4212  AsnC family transcriptional regulator  40.41 
 
 
157 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642978  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4188  AsnC family transcriptional regulator  41.45 
 
 
188 aa  91.3  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4765  transcriptional regulator, AsnC family  39.73 
 
 
157 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1269  AsnC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
160 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0521  AsnC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0209927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0537  transcriptional regulator, AsnC family  41.1 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.863753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0270  transcriptional regulator, AsnC family  38.1 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000296177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1393  AsnC family transcriptional regulator  37.68 
 
 
159 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00371319  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0831  AsnC family transcriptional regulator  32.19 
 
 
174 aa  87.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.161964  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  38.13 
 
 
153 aa  87  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2396  AsnC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.371515  decreased coverage  0.00000671119 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1414  AsnC family transcriptional regulator  31.65 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.595573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0345  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 
160 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0877618  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
151 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1768  transcriptional regulator, AsnC family  31.51 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.897944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  39.71 
 
 
153 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1589  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 
174 aa  85.5  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4567  transcriptional regulator, AsnC family  38.69 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  36.24 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0761  transcription regulator protein  36.05 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.308793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0427  transcriptional regulator, AsnC family  39.58 
 
 
150 aa  84.7  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2774  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 
156 aa  84.7  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.587297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  36.24 
 
 
162 aa  84.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4859  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 
155 aa  84.3  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0557  AsnC family transcriptional regulator  31.08 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8068  transcriptional regulator, AsnC family  36.5 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13320  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5321  transcriptional regulator, AsnC family  34.53 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4922  AsnC family transcriptional regulator  33.1 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.56737  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2748  AsnC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.784147  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0634  AsnC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00290535  normal  0.330674 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0581  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58208  hitchhiker  0.000000374814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  32.12 
 
 
152 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1429  AsnC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5850  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800355  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
151 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1915  putative transcriptional regulator, AsnC family  35.57 
 
 
157 aa  82  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.513338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1501  AsnC family transcriptional regulator  34.93 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449471  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2780  AsnC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.624178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3914  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  34.75 
 
 
158 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4454  AsnC family transcriptional regulator  35.77 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2359  transcriptional regulator, AsnC family  34.93 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.307081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2874  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420879  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3011  AsnC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5805  transcriptional regulator, AsnC family  38.03 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0160115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0918  transcriptional regulator, AsnC family  30.82 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2863  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0987  AsnC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.284235  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2509  AsnC family transcriptional regulator  37.9 
 
 
151 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0963881  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
149 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3888  AsnC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3606  AsnC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3654  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
150 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.652565  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0458  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.302522  normal  0.60857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  39.44 
 
 
160 aa  80.1  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3512  AsnC family transcriptional regulator  38.71 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.122757  normal  0.0537106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4299  helix-turn-helix, Fis-type  34.01 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0440878  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2076  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0777  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.079417  normal  0.163575 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5879  AsnC family transcriptional regulator  36.99 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0404576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0711  transcriptional regulator, AsnC family  36.05 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12856  normal  0.032532 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  36.43 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3514  AsnC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0500665  normal  0.428471 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3914  AsnC family transcriptional regulator  40 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.529423 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0952  transcriptional regulator, AsnC family  29.45 
 
 
174 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.70938  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1991  AsnC family transcriptional regulator  34.46 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158914  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4456  transcriptional regulator, AsnC family  38.58 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.707802 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1665  AsnC family transcriptional regulator  35.66 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  32.43 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1560  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 
168 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.129172  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4856  transcriptional regulator, AsnC family  33.57 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00513546  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4160  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
153 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>